El sistema de gobierno en cadena de ZKsync está diseñado alrededor del principio de la separación y el equilibrio de poderes, asegurando que cualquier cambio en el protocolo requiera la aprobación conjunta de tres instituciones independientes. Estas tres instituciones son la comunidad de titulares de tokens, la comisión de seguridad y los encargados de cumplir con valores compartidos, cada una de las cuales tiene un control independiente sobre el proceso de toma de decisiones. La Asamblea de Titulares de Tokens otorga a los titulares y representantes el derecho a presentar e votar en la cadena propuestas para actualizaciones del protocolo. La comisión de seguridad está compuesta por expertos técnicos, encargados de revisar y aprobar las actualizaciones del protocolo y, en situaciones de emergencia, tienen el poder de bloquear el protocolo. Además, los encargados garantizan que las propuestas de gobierno se ajusten a los valores centrales de ZKsync. El sistema apoya tres tipos de propuestas: propuestas de Mejora de ZKsync (ZIPs), propuestas de Plan de Token (TPPs) y propuestas de Consultoría de Gobierno (GAPs), con el objetivo de promover un camino de desarrollo de protocolo más transparente, seguro y orientado a valores.